Ympäristönsuojelu tekee yhteistyötä Kolarin, Pellon, Ranuan, Tervolan ja Ylitornion kuntien kanssa. Yhteistyö pitää sisällään ympäristönsuojeluviranomaiselle lainsäädännöllä määrättyjen tehtävien kuten lupa- ja valvonta-asioiden hoitamisen.
Kuntayhteistyö alkoi Rovaniemen kaupungin ja Ranuan kunnan välisellä sopimuksella vuonna 2008. Yhteistyö Ranuan kanssa jatkuu edelleen ja sittemmin yhteistoiminta on käynnistetty myös Kolarin, Pellon, Tervolan ja Ylitornion kuntien kanssa.